使っていないとつい忘れてしまうような、細かいことをメモしていきます。
パッケージエクスプローラー内でプロジェクト名を選択して、右クリック。"Tomcatプロジェクト→プロジェクト設定に従いWARファイルを作成する" を選択すると、WARファイルが作成されます。作成先は、プロジェクトのプロパティのTomcatメニューにある"Export to WAR"タブ内の"閲覧"ボタンを押せば分かります。
${TOMCAT_HOME}/conf/Catalina/localhost/lso3.xml というような形で、設定ファイルが存在する。その中にディレクトリ位置を指定している。